В настоящее время известны два вируса, написанные на языке Java. Опасности они практически не представляют. Кратко поясним, в чем суть. Исполняемые модули программ, написанных на Java (CLASS-файлы), бывают двух типов: приложения и аплеты. Приложения выполняются под управлением интерпретатора и являются почти обычными программами (почти, ибо имеются все же некоторые ограничения, например, в области работы с памятью). Аплеты, в отличие от приложений, могут выполняться под управлением броузеров, но на них накладываются значительно более серьезные ограничения для обеспечения безопасности: аплеты, в частности, не имеют почти никакого доступа к файловой системе локального компьютера (кстати, в отличие от случая со скриптами отключить данное ограничение в броузере невозможно). Таким образом, Java-вирусы могут быть оформлены только как приложения и для подавляющего большинства пользователей опасности не представляют.

Отметим, что возможность заражения файлов на сервере HTML- и Java-вирусами практически исключена (администратор такого сервера для этого должен совершить вопиющие ошибки). Так что распространять такие вирусы могут лишь серверы с определенной репутацией.